Regulación a nivel transcripcional y post-transcripcional de las subunidades Tpk1, Tpk2, Tpk3 y Bcy1

La regulación de cada una de las isoformas de Tpks y Bcy1 sería diferente ante un mismo estímulo y reguladas también diferencialmente ante distintas condiciones del medio, como disponibilidad de fuente de carbono, disponibilidad de fosfato, estrés, fase de crecimiento o quiescencia. Si bien se demostró que las tres isoformas son funcionalmente redundantes para la viabilidad celular, cada isoforma de Tpk está a involucrada específicamente en ciertos procesos celulares. Proponemos otros puntos de control para lograr la especificidad en la respuesta de la señal de PKA, más allá de la localización específica de la holoenzima que permitiría su acercamiento a determinados sustratos. La hipótesis de trabajo es que la especificidad de respuesta dada por cada isoforma de Tpk podría estar influenciada por la regulación diferencial de la expresión de las subunidades, regulatoria y catalíticas, y de la expresión diferencial a su vez de cada isoforma Tpk. El resultado de esta regulación seria variaciones en la abundancia proteica relativa entre las isoformas catalíticas y la subunidad regulatoria frente a distintos estímulos como distintas condiciones de estrés, estadios de crecimiento y distintas condiciones del medio de crecimiento como disponibilidad de fuentes de carbono y de fosfato.

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Estudiamos la regulación de cada subunidad a nivel transcripcional y post-transcripcional y dentro de esta última a nivel de estabilidad y regulación traduccional de los mRNAs de cada subunidad en las condiciones mencionadas. A nivel transcripcional se estudia los reguladores de la actividad de cada promotor y de la estructura de la cromatina de los mismos no solo a nivel individual sino tambien realizando un Análisis Genético Global de reguladores de la transcripción de cada subunidad de PKA, utilizado la metodología de SGA (“synthetic genetic array”) de doble sistema de reportero para poder hacer una descripción completa de las interacciones gen-regulador que determinan la expresión global de los genes TPK1, TPK2, TPK3 y BCY1. A nivel post-transcripcional nos centramos en el estudio de uORFs presentes en la región 5´ UTR de los mRNAs que pueden afectar la traducción. Finalmente estudiamos la regulación de la estabilidad de los mRNAs que codifica para cada subunidad definida por elementos presentes tanto en los extremos 3’UTRs como por distintos elementos presentes en el 5´UTR y/o promotores de los genes que codifican para cada subunidad teniendo en cuenta las últimas teorías que indican que la expresión expresión génica es un proceso circular en el cual los que hasta ahora han sido determinados como primer y último paso del mismo están interconectados y son dependientes.